Le Collège international de philosophie est une association sous le régime de la loi de 1901 agréée comme organisme de recherche par le Ministère chargé de la Recherche et par le Ministère des Finances (Article 238 bis A du C.G.I.).

Il est administré par un conseil d'administration qui élit en son sein un président et un bureau. Le conseil d'administration délibère sur les questions administratives et financières. Un conseil scientifique, nommé le 28 novembre 1994 par le Ministre de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, exprime un avis sur les orientations et procède à l'évaluation de l'ensemble des actions entreprises par l'association. Il transmet aux différents ministres un rapport sur les activités du Collège. Une cellule administrative assure le fonctionnement logistique et financier.

L'activité philosophique, scientifique et de recherche est animée par une assemblée collégiale composée de 50 « Directeurs de programme » nommés pour six ans.